Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Urb2E9Q7L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms