Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms