Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup153E9Q3G8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup153E9Q3G8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup153E9Q3G8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms