Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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