Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd1E9PZ26 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms