Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syde2E9PUP1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms