Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms