Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms