Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20547B8JJN0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms