Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms