Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms