Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms