Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms