Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbed5B2RPU8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Zbed5B2RPU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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