Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprsB0V2N1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms