Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Odf2A3KGV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Odf2A3KGV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2A3KGV1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms