Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CatsperbA2RTF1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms