Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Btbd35f28A2CFD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f28A2CFD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms