Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms