Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Frmpd1A2AKB4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Frmpd1A2AKB4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Frmpd1A2AKB4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms