Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms