Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms