Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frmpd4A2AFR3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms