Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2dnl1A2AFH1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2dnl1A2AFH1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms