Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm25193-201ENSMUST00000176615 97 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm933-201ENSMUST00000179384 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm6150-201ENSMUST00000217775 577 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms