Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
P20040 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
P20040 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
P20040 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
P20040 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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