Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dbt-201ENSMUST00000000349 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Crbn-201ENSMUST00000013882 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm3854-201ENSMUST00000207173 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37702-201ENSMUST00000194357 1872 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ighv1-85-201ENSMUST00000103552 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rhox4f-201ENSMUST00000115170 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14514-201ENSMUST00000121680 940 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12751-201ENSMUST00000122336 381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm22198-201ENSMUST00000122659 307 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4933406J10Rik-201ENSMUST00000144828 963 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm21976-202ENSMUST00000180066 831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm17800-201ENSMUST00000182466 971 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Nsg1-205ENSMUST00000201415 883 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC140409.1-201ENSMUST00000213907 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm35177-201ENSMUST00000216525 623 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm4257-201ENSMUST00000222877 513 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC138667.1-201ENSMUST00000225472 316 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm10036-201ENSMUST00000079733 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sat2-201ENSMUST00000092969 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm10577-201ENSMUST00000097954 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms