Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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