Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 B230311B06Rik-202ENSMUST00000207610 687 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Cldn34b1-201ENSMUST00000096852 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm8354-201ENSMUST00000189223 1373 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trappc2Q9CQP2 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s102-201ENSMUST00000101990 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s101-201ENSMUST00000177910 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s114-201ENSMUST00000178297 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s119-201ENSMUST00000178861 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s127-201ENSMUST00000179185 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm3591-202ENSMUST00000179312 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s129-201ENSMUST00000180122 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 n-R5s131-201ENSMUST00000180280 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm27283-201ENSMUST00000184853 323 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 1700022H16Rik-201ENSMUST00000188935 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 AC132247.1-201ENSMUST00000225930 585 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Lnpk-202ENSMUST00000102676 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trappc2Q9CQP2 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms