Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
Siah1bQ06985 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms