Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Olfr297-201ENSMUST00000071112 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rarres2-201ENSMUST00000009425 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15495-201ENSMUST00000117570 1312 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11237-201ENSMUST00000178319 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11487-201ENSMUST00000084480 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm16575-201ENSMUST00000162186 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Reg3a-201ENSMUST00000101272 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm25092-201ENSMUST00000103996 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm22471-201ENSMUST00000104116 130 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9844-201ENSMUST00000170837 485 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20492-201ENSMUST00000172591 286 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm25196-201ENSMUST00000180171 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44928-201ENSMUST00000208098 128 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC140409.1-202ENSMUST00000216792 432 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Anapc15-ps-202ENSMUST00000218771 399 ntAPPRIS P5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC158603.2-201ENSMUST00000219191 315 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mbl2-201ENSMUST00000025797 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr460-201ENSMUST00000051540 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Krtap10-4-201ENSMUST00000092369 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm10272-201ENSMUST00000092371 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms