Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Acad12-201ENSMUST00000041252 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Fn3k-203ENSMUST00000103014 3841 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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