Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm44257-201ENSMUST00000204469 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms