Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms