Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SrprbP47758 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms