Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Ighv1-55-201ENSMUST00000103526 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Rps14-203ENSMUST00000122279 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm3571-201ENSMUST00000170703 1060 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 AC154028.1-201ENSMUST00000217071 379 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cd28P31041 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms