Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ackr1-201ENSMUST00000038227 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm10024-201ENSMUST00000075421 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 E230016K23Rik-201ENSMUST00000125626 2139 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gpx5-201ENSMUST00000110491 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ctf2-201ENSMUST00000076091 1754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Igkv2-112-202ENSMUST00000103319 358 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14813-201ENSMUST00000122291 395 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm11999-201ENSMUST00000145789 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm23833-201ENSMUST00000158900 252 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6723-201ENSMUST00000180449 441 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm29444-201ENSMUST00000187152 1156 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Krtap14-202ENSMUST00000189774 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm40117-201ENSMUST00000198827 369 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45213-201ENSMUST00000206065 304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC123944.1-201ENSMUST00000213414 160 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC140406.2-201ENSMUST00000227539 481 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tas2r138-201ENSMUST00000076565 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms