Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Lyrm1-207ENSMUST00000208202 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mir7659-201ENSMUST00000184079 58 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms