Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms