Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 4933400L20Rik-202ENSMUST00000211119 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm18029-201ENSMUST00000219973 844 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Rpl21-ps12-201ENSMUST00000080061 480 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm23405-201ENSMUST00000082542 160 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm7125-201ENSMUST00000093430 273 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Nobox-201ENSMUST00000031749 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Wfikkn2-201ENSMUST00000061469 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Kpna7-201ENSMUST00000110672 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Ubash3b-206ENSMUST00000151485 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Ackr4-203ENSMUST00000188000 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Alox15-201ENSMUST00000019068 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Mcm5-203ENSMUST00000212426 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Camk2a-201ENSMUST00000025519 3244 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Znf48Q3US17 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Spn-201ENSMUST00000049931 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Sox5-204ENSMUST00000111748 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr156-201ENSMUST00000079234 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Hdac9-207ENSMUST00000210724 2811 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tmem135-201ENSMUST00000041968 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 2310015K22Rik-201ENSMUST00000191452 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cwc25-201ENSMUST00000018685 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm15635-201ENSMUST00000127834 371 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm13564-201ENSMUST00000131533 657 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm11382-201ENSMUST00000140484 179 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 9230117E06Rik-201ENSMUST00000159309 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm8379-201ENSMUST00000165448 1192 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1700019N19Rik-202ENSMUST00000166692 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm2907-201ENSMUST00000181256 1192 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm27500-201ENSMUST00000184331 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms