Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sag-209ENSMUST00000177757 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm24786-201ENSMUST00000157379 109 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Myl1-207ENSMUST00000186202 874 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm28476-201ENSMUST00000190540 696 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC164105.1-202ENSMUST00000213920 999 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm7979-201ENSMUST00000223009 1025 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm37266-201ENSMUST00000193802 2287 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr631-201ENSMUST00000106863 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm13863-201ENSMUST00000118782 602 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm3244-201ENSMUST00000120938 390 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm9637-201ENSMUST00000179141 873 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm28865-201ENSMUST00000187685 723 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms