Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SrprbP47758 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms