Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4930528P14Rik-201ENSMUST00000152815 509 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6919-201ENSMUST00000180049 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gabra4-203ENSMUST00000198138 440 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15738-205ENSMUST00000210378 1051 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC140462.1-201ENSMUST00000225776 853 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sncg-201ENSMUST00000023826 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dmrtc1a-201ENSMUST00000033686 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Igkv2-112-202ENSMUST00000103319 358 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ighv3-8-201ENSMUST00000103483 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Snord88c-201ENSMUST00000116853 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rps10-ps4-201ENSMUST00000120308 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14673-201ENSMUST00000121973 746 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm24062-201ENSMUST00000157490 266 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm17088-201ENSMUST00000164616 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mrgpra2b-202ENSMUST00000172559 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ube2i-212ENSMUST00000174001 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm28865-201ENSMUST00000187685 723 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1700120C14Rik-201ENSMUST00000187706 326 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm35067-201ENSMUST00000194355 647 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ighv1-13-202ENSMUST00000195668 350 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm36539-201ENSMUST00000217543 497 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.1 ms