Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm12917-201ENSMUST00000119850 639 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm15864-201ENSMUST00000145950 369 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm37787-201ENSMUST00000192524 585 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Cldn34c3J3QJW5 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm6150-201ENSMUST00000217775 577 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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