Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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