Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Scmh1-204ENSMUST00000106301 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Ctnna3-203ENSMUST00000105441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Tnf-202ENSMUST00000167924 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Dlx1as-203ENSMUST00000140271 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 AC091683.2-201ENSMUST00000222996 1185 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Vmn2r53-201ENSMUST00000170412 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Tnfrsf1b-201ENSMUST00000030336 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Pax6-205ENSMUST00000111085 2779 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Ccser2-207ENSMUST00000182797 1482 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Smg9Q9DB90 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms