Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Asns-201ENSMUST00000031766 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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