Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SrprbP47758 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms