Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 2310015K22Rik-201ENSMUST00000191452 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms