Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gpr171-201ENSMUST00000085040 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Xpnpep2-202ENSMUST00000114998 3017 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700028E10Rik-203ENSMUST00000201142 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms